IT

Networked IT infrastructure for multicentre sample collections.

GBN’s IT network links biobanks and facilitates the search for human biosamples and associated data across multiple locations.

 

Bei dem im Mai 2021 gestartete Projekt ABIDE_MI („Aligning Biobanking and DIC Efficiently“) handelt es sich um ein erweitertes Förderungsmodul der Medizininformatik-Initiative (MII), das die Verbindung zentraler Forschungsinfrastrukturen an den universitätsmedizinischen Standorten in Deutschland zum Ziel hat. Mit dem Vorhaben sollen insbesondere Bioproben- und Patient*innendaten aus der Routineversorgung verknüpft und gemeinsam für die Forschung nutzbar gemacht werden. Dazu verbindet ABIDE_MI Biobanken und Datenintegrationszentren (DIZ) auf technischer und regulatorischer Ebene. Beteiligt sind neben dem German Biobank Node (GBN) 24 Standorte der Universitätsmedizin bundesweit sowie die Koordinationsstelle der MII. ABIDE_MI wird bis Oktober 2022 vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) mit rund fünf Millionen Euro gefördert. 

Das Projekt umfasst 

  • die Entwicklung von Methoden, die es Biobanken ermöglicht, Patient*innendaten mit Bioproben zu verknüpfen, welche im Kontext der Patient*innenversorgung von Universitätskliniken gesammelt wurden und in den Biobanken vorhanden sind, 

  • die Etablierung eines zentralen FHIR-basierten, Machbarkeits- Abfragetools für die Identifizierung von Patient*innengruppen mit entsprechenden Bioproben,

  • die Entwicklung von Softwarewerkzeugen und deren einfache Verbreitung über Software-Container auch an neu hinzukommende MII-Standorte, 

  • den Aufbau einer skalierbaren Infrastruktur, die eine nahtlose Verbindung der MII-DIZ mit dem europäischen IT-Portal von BBMRI-ERIC zur Verwaltung von Bioproben aus dem Gesundheitswesen ermöglicht. 

 

Projektleitung

Prof. Dr. Hans-Ulrich Prokosch

Prof. Dr. Hans-Ulrich Prokosch

Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg

Prof. Dr. Michael Hummel

German Biobank Node (GBN) 

Questions?

germanbiobanknode@charite.de

Tel. +49. 30. 450 536 347


Fax +49. 30. 450 753 69 38

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